A mi siempre me gustó tener un antivirus y escanear de vez en cuando el sistema como medida de prevención, pero si se me infectaba un sistema, mi método preferido era el escanear dicho disco desde un sistema totalmente limpio y he aquí donde las LiveCD tienen mucho que decir.
BitDefender ofrece una LiveCD con la versión gratuita de su antivirus. Para usarla sólo tienes que descargar y quemar la imagen en un CD. Arrancas con el mismo y a escanear se dijo.
Otro recurso para la colección.