Cómo crear tu propia distribución Ubuntu
Con Reconstructor podrás seleccionar las aplicaciones y paquetes que quieras para tu distribución Ubuntu y algunos otros ajustes para personalizarlo.
En LifeHacker te explican paso a paso cómo crearla.
En LifeHacker te explican paso a paso cómo crearla.

En PC Plus ofrecen un artículo muy interesante de como construir tu propia distribución de Linux. No sólo te permita personalizarla, si no que tambien es capaz de crearte una ISO para usarla como LiveCD o desde tu USB drive. El software que usan se llama Revisor y parece ser que está pensado para Fedora. Tiene una pinta muy buena y parece muy sencillo de usar.
Si eres usuario de SuSE pues también estás de suerte, ya lago parecdio sacaron los de Novel llamado SUSE Studio.